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Revue des Sciences et Technologies de l'Information
 

 ARTICLE VOL 27/4-5 - 2013  - pp.539-568  - doi:10.3166/ria27.539-568
TITRE
Intégration de données hétérogènes et imprécises guidée par une ressource termino-ontologique

TITLE
Heterogeneous and imprecise data integration guided by an ontological and terminological resource. Application to life sciences

RÉSUMÉ

Cet article présente les enjeux de l’ingénierie des connaissances dans le domaine des sciences du vivant et, à titre d’illustration, un système d’intégration de données thématiques ouvert sur le web, appelé ONDINE (Ontology based Data INtEgration). Ce système propose un processus complet d’acquisition, d’annotation sémantique et d’interrogation de données à partir de tableaux trouvés dans des documents scientifiques issus du web. L’élément central du système ONDINE est une ressource termino-ontologique (RTO) qui permet la représentation de relations n-aires et dont les concepts sont utilisés pour annoter des tableaux de données. Nous présentons le modèle de la RTO, la méthode d’annotation semi-automatique de tableaux de données guidée par cette RTO, puis le logiciel @Web (Annotating Tables from the Web) d’annotation sémantique de tableaux.



ABSTRACT

In this paper we present some issues of knowledge engineering in the field of life sciences and, as an illustration, a data integration system opened on the Web, called ONDINE (Ontology based Data INtEgration), which proposes a complete workflow to extract, to semantically annotate and to query data from tables found in scientific documents from the Web. The core and key element of ONDINE is an Ontological and terminological Resource (OTR) allowing the modeling of n-ary relations; concepts from this OTR are used to annotate tables. First we present the OTR model, then the semi-automatic method for semantic annotation of tables guided by this OTR, and finally our software system, @Web (Annotating Tables from the Web), designed to semantically annotate tables.



AUTEUR(S)
Patrice BUCHE , Stéphane DERVAUX , Juliette DIBIE-BARTHÉLEMY , Lydie SOLER , Liliana IBANESCU, Rim TOUHAMI

MOTS-CLÉS
intégration de données, annotation sémantique, ontologie, web de données

KEYWORDS
data integration, semantic annotation, ontology, linked data

LANGUE DE L'ARTICLE
Français

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