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Revue des Sciences et Technologies de l'Information
 

 ARTICLE VOL 17/1-3 - 2003  - pp.13-23
TITRE
IMGT-ONTOLOGY : gestion et découverte de connaissances au sein d'IMGT

RÉSUMÉ
IMGT, the international ImMunoGeneTics database® (http://imgt.cines.fr) est un système d'information intégré de grande qualité, spécialisé dans les immunoglobulines, les récepteurs T et le Complexe Majeur d'Histocompatibilité de l'homme et des autres vertébrés, créé en 1989, par le Laboratoire d'ImmunoGénétique Moléculaire (LIGM), à l'Université Montpellier II, CNRS, Montpellier, France. IMGT comprend plusieurs bases de données de séquences (IMGT/LIGM-DB, IMGT/MHC-DB, IMGT/PRIMER-DB), de gènes (IMGT/GENEDB) et de structures 3D (IMGT/3Dstructure-DB), des ressources Web de 8000 pages HTML ("IMGT Marie-Paule page") et des outils interactifs (IMGT/V-QUEST, IMGT/JunctionAnalysis, IMGT/Allele-Align, IMGT/PhyloGene). Nous décrivons les principaux concepts d'IMGT-ONTOLOGY qui permettent la gestion et la découverte de connaissances au sein d'IMGT.


ABSTRACT
IMGT, the international ImMunoGeneTics database® (http://imgt.cines.fr), is a high quality integrated information system specializing in Immunoglobulins, T cell Receptors and Major Histocompatibility Complex of human and other vertebrates, created in 1989, by the laboratoire d'ImmunoGénétique Moléculaire (LIGM), at the Université Montpellier II, CNRS, Montpellier, France. IMGT includes three sequence databases (IMGT/LIGM-DB, IMGT/MHC-DB, IMGT/PRIMER-DB), one genome database (IMGT/GENE-DB), one 3D structure database (IMGT/3Dstructure-DB), Web resources comprising 8000 HTML pages ("IMGT Marie-Paule page") and interactive tools for sequence analysis (IMGT/V-QUEST, IMGT/JunctionAnalysis, IMGT/Allele-Align, IMGT/PhyloGene). We describe the main IMGTONTOLOGY concepts which allow the knowledge management and extraction from the IMGT information system.


AUTEUR(S)
Véronique GIUDICELLI, Marie-Paule LEFRANC

MOTS-CLÉS
base de données, immunoinformatique, connaissance, ontologie, immunoglobuline, récepteur, CMH, anticorps.

KEYWORDS
database, immunoinformatics, knowledge, ontology, immunoglobulin, T cell receptor, MHC, antibody 1.

LANGUE DE L'ARTICLE
Français

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